๐Ÿงฌ ์—ผ์ƒ‰์ฒด ์˜์—ญ ๊ฐ„ ์ƒํ˜ธ์ž‘์šฉ: Hi-C ๊ธฐ์ˆ ์˜ ์‘์šฉ ๐Ÿ”ฌ

์ฝ˜ํ…์ธ  ๋Œ€ํ‘œ ์ด๋ฏธ์ง€ - ๐Ÿงฌ ์—ผ์ƒ‰์ฒด ์˜์—ญ ๊ฐ„ ์ƒํ˜ธ์ž‘์šฉ: Hi-C ๊ธฐ์ˆ ์˜ ์‘์šฉ ๐Ÿ”ฌ

 

 

์•ˆ๋…•, ์นœ๊ตฌ๋“ค! ์˜ค๋Š˜์€ ์ •๋ง ํฅ๋ฏธ์ง„์ง„ํ•œ ์ฃผ์ œ๋กœ ์šฐ๋ฆฌ ๋ชธ์† ๊นŠ์ˆ™ํ•œ ๊ณณ์—์„œ ์ผ์–ด๋‚˜๋Š” ์‹ ๋น„๋กœ์šด ์ผ์— ๋Œ€ํ•ด ์–˜๊ธฐํ•ด๋ณผ ๊ฑฐ์•ผ. ๋ฐ”๋กœ ์—ผ์ƒ‰์ฒด ์˜์—ญ ๊ฐ„ ์ƒํ˜ธ์ž‘์šฉ์ด๋ผ๋Š” ๊ฑฐ์ง€. ๋ญ”๊ฐ€ ์–ด๋ ค์›Œ ๋ณด์ด๋Š” ๋ง์ด์ง€๋งŒ, ๊ฑฑ์ • ๋งˆ! ๋‚ด๊ฐ€ ์‰ฝ๊ณ  ์žฌ๋ฏธ์žˆ๊ฒŒ ์„ค๋ช…ํ•ด์ค„ ํ…Œ๋‹ˆ๊นŒ. ๐Ÿ˜‰

์šฐ๋ฆฌ ๋ชธ์„ ์ด๋ฃจ๋Š” ์„ธํฌ ์•ˆ์—๋Š” DNA๋ผ๋Š” ์•„์ฃผ ์ค‘์š”ํ•œ ๋ฌผ์งˆ์ด ์žˆ์–ด. ์ด DNA๊ฐ€ ๋ชจ์—ฌ์„œ ๋งŒ๋“ค์–ด์ง„ ๊ฒŒ ๋ฐ”๋กœ ์—ผ์ƒ‰์ฒด์•ผ. ๊ทผ๋ฐ ์ด ์—ผ์ƒ‰์ฒด๋“ค์ด ๊ทธ๋ƒฅ ๊ฐ€๋งŒํžˆ ์žˆ๋Š” ๊ฒŒ ์•„๋‹ˆ๋ผ, ์„œ๋กœ ์†Œํ†ตํ•˜๊ณ  ์ƒํ˜ธ์ž‘์šฉํ•œ๋‹ค๋Š” ๊ฑฐ ์•Œ๊ณ  ์žˆ์—ˆ์–ด? ๊ทธ๊ฒƒ๋„ ์•„์ฃผ ๋ณต์žกํ•˜๊ณ  ์ •๊ตํ•˜๊ฒŒ ๋ง์ด์•ผ! ๐Ÿคฏ

์ด๋Ÿฐ ์—ผ์ƒ‰์ฒด๋“ค์˜ ์ˆ˜๋‹ค ํŒŒํ‹ฐ๋ฅผ ๋“ค์—ฌ๋‹ค๋ณด๊ธฐ ์œ„ํ•ด ๊ณผํ•™์ž๋“ค์ด ๊ฐœ๋ฐœํ•œ ์ดˆ๊ฐ•๋ ฅ ๊ธฐ์ˆ ์ด ์žˆ์–ด. ๋ฐ”๋กœ Hi-C ๊ธฐ์ˆ ์ด๋ผ๊ณ  ํ•ด. ์ด ๊ธฐ์ˆ ์„ ์ด์šฉํ•˜๋ฉด ์—ผ์ƒ‰์ฒด๋“ค์ด ์–ด๋–ป๊ฒŒ ์ ‘ํ˜€ ์žˆ๊ณ , ์–ด๋–ค ๋ถ€๋ถ„๋“ค์ด ์„œ๋กœ ๊ฐ€๊นŒ์ด ์žˆ๋Š”์ง€ ์•Œ ์ˆ˜ ์žˆ์ง€. ๋งˆ์น˜ 3D ์ง€๋„๋ฅผ ๊ทธ๋ฆฌ๋Š” ๊ฒƒ์ฒ˜๋Ÿผ ๋ง์ด์•ผ! ๐Ÿ—บ๏ธ

์ž, ์ด์ œ๋ถ€ํ„ฐ ์šฐ๋ฆฌ๋Š” ์ด Hi-C ๊ธฐ์ˆ ์„ ํƒ€๊ณ  DNA์˜ ์„ธ๊ณ„๋กœ ๋ชจํ—˜์„ ๋– ๋‚  ๊ฑฐ์•ผ. ์ค€๋น„๋๋‹ˆ? ๊ทธ๋Ÿผ ์ถœ๋ฐœ~! ๐Ÿš€

๐Ÿง  ์—ผ์ƒ‰์ฒด, ๋„Œ ๋Œ€์ฒด ๋ญ๋‹ˆ?

๋จผ์ € ์—ผ์ƒ‰์ฒด์— ๋Œ€ํ•ด ์ข€ ๋” ์ž์„ธํžˆ ์•Œ์•„๋ณด์ž. ์—ผ์ƒ‰์ฒด๋Š” ์šฐ๋ฆฌ ๋ชธ์˜ ์„ค๊ณ„๋„๋ผ๊ณ  ํ•  ์ˆ˜ ์žˆ์–ด. ํ‚ค๊ฐ€ ํฌ๊ณ  ์ž‘์€์ง€, ๋ˆˆ ์ƒ‰๊น”์ด ์–ด๋–ค์ง€, ์‹ฌ์ง€์–ด ์–ด๋–ค ์งˆ๋ณ‘์— ๊ฑธ๋ฆฌ๊ธฐ ์‰ฌ์šด์ง€๊นŒ์ง€ ๋ชจ๋“  ์ •๋ณด๊ฐ€ ์ด ์—ผ์ƒ‰์ฒด ์•ˆ์— ๋“ค์–ด์žˆ์ง€.

์ธ๊ฐ„์€ ์ด 23์Œ, ์ฆ‰ 46๊ฐœ์˜ ์—ผ์ƒ‰์ฒด๋ฅผ ๊ฐ€์ง€๊ณ  ์žˆ์–ด. ์ด ์ค‘ 22์Œ์€ ์ƒ์—ผ์ƒ‰์ฒด๋ผ๊ณ  ํ•˜๊ณ , ๋‚˜๋จธ์ง€ 1์Œ์€ ์„ฑ์—ผ์ƒ‰์ฒด์•ผ. ์„ฑ์—ผ์ƒ‰์ฒด๋Š” ์šฐ๋ฆฌ์˜ ์„ฑ๋ณ„์„ ๊ฒฐ์ •ํ•˜๋Š” ์ค‘์š”ํ•œ ๋…€์„์ด์ง€.

๐Ÿง ์žฌ๋ฏธ์žˆ๋Š” ์‚ฌ์‹ค: ์—ผ์ƒ‰์ฒด์˜ ๋ชจ์–‘์ด X์ž์ฒ˜๋Ÿผ ์ƒ๊ฒผ๋‹ค๊ณ  ํ•ด์„œ X์—ผ์ƒ‰์ฒด๋ผ๊ณ  ๋ถ€๋ฅด๊ฒŒ ๋์–ด. Y์—ผ์ƒ‰์ฒด๋Š” X์—ผ์ƒ‰์ฒด๋ณด๋‹ค ์กฐ๊ธˆ ์ž‘๊ณ  ๋‹ค๋ฆฌ ํ•˜๋‚˜๊ฐ€ ์—†์–ด์„œ Y์ž์ฒ˜๋Ÿผ ๋ณด์ธ๋‹ค๊ณ  ํ•ด์„œ ๊ทธ๋ ‡๊ฒŒ ์ด๋ฆ„ ๋ถ™์—ฌ์กŒ์ง€!

์—ผ์ƒ‰์ฒด๋Š” ๋ณดํ†ต ์„ธํฌํ•ต ์•ˆ์— ์žˆ์–ด. ํ•˜์ง€๋งŒ ์„ธํฌ๊ฐ€ ๋ถ„์—ดํ•  ๋•Œ๋Š” ๊ฝ‰ ๊ฝ‰ ๋ญ‰์ณ์„œ ํ˜„๋ฏธ๊ฒฝ์œผ๋กœ๋„ ๋ณผ ์ˆ˜ ์žˆ์„ ์ •๋„๋กœ ์ปค์ง„๋‹จ๋‹ค. ์ด๋•Œ ์—ผ์ƒ‰์ฒด์˜ ๋ชจ์Šต์„ ๋ณด๋ฉด ๋งˆ์น˜ ๊ผฌ์ธ ์‹คํƒ€๋ž˜ ๊ฐ™์•„ ๋ณด์—ฌ. ๐Ÿงต

๊ทธ๋Ÿฐ๋ฐ ๋ง์ด์•ผ, ์ด ์—ผ์ƒ‰์ฒด๋“ค์ด ๊ทธ๋ƒฅ ๊ฐ€๋งŒํžˆ ์žˆ๋Š” ๊ฒŒ ์•„๋‹ˆ๋ผ ์„œ๋กœ ์ด๋ฆฌ์ €๋ฆฌ ์›€์ง์ด๋ฉด์„œ ์ƒํ˜ธ์ž‘์šฉ์„ ํ•œ๋‹ค๋Š” ๊ฑฐ์•ผ. ์–ด๋–ป๊ฒŒ ๊ทธ๋Ÿฐ ์ผ์ด ๊ฐ€๋Šฅํ• ๊นŒ? ๊ทธ ๋น„๋ฐ€์„ ํ’€๊ธฐ ์œ„ํ•ด ๊ณผํ•™์ž๋“ค์ด ์—ด์‹ฌํžˆ ์—ฐ๊ตฌํ•˜๊ณ  ์žˆ์–ด.

์—ผ์ƒ‰์ฒด์˜ ๊ตฌ์กฐ ์—ผ์ƒ‰์ฒด ์„ผํŠธ๋กœ๋ฏธ์–ด DNA

์œ„์˜ ๊ทธ๋ฆผ์„ ๋ณด๋ฉด ์—ผ์ƒ‰์ฒด์˜ ๊ธฐ๋ณธ ๊ตฌ์กฐ๋ฅผ ์•Œ ์ˆ˜ ์žˆ์–ด. ๊ฐ€์šด๋ฐ ์ข์•„์ง„ ๋ถ€๋ถ„์„ ์„ผํŠธ๋กœ๋ฏธ์–ด๋ผ๊ณ  ํ•˜๊ณ , ์–‘์ชฝ์œผ๋กœ ๋ป—์€ ๋ถ€๋ถ„์„ ์—ผ์ƒ‰์ฒด ํŒ”์ด๋ผ๊ณ  ํ•ด. ์ด ๊ตฌ์กฐ๊ฐ€ X์ž ๋ชจ์–‘์œผ๋กœ ๋ณด์ด๋Š” ๊ฑฐ์ง€.

๊ทธ๋Ÿฐ๋ฐ ๋ง์ด์•ผ, ์ด๋ ‡๊ฒŒ ๊ผฌ๋ถˆ๊ผฌ๋ถˆ ๋ญ‰์ณ์žˆ๋Š” ์—ผ์ƒ‰์ฒด๋“ค์ด ์–ด๋–ป๊ฒŒ ์„œ๋กœ ์†Œํ†ตํ•  ์ˆ˜ ์žˆ์„๊นŒ? ๊ทธ ๋น„๋ฐ€์„ ๋ฐํ˜€๋‚ด๊ธฐ ์œ„ํ•ด ๊ณผํ•™์ž๋“ค์ด ๊ฐœ๋ฐœํ•œ ๊ฒŒ ๋ฐ”๋กœ Hi-C ๊ธฐ์ˆ ์ด์•ผ. ์ด์ œ ๊ทธ ๋†€๋ผ์šด ๊ธฐ์ˆ ์— ๋Œ€ํ•ด ์•Œ์•„๋ณด์ž!

์•„, ๊ทธ๋ฆฌ๊ณ  ์ž ๊น! ๐Ÿค” ์ด๋Ÿฐ ๋ณต์žกํ•œ ๊ณผํ•™ ์ง€์‹์„ ์ดํ•ดํ•˜๊ณ  ๋‚˜๋ˆ„๋Š” ๊ฒƒ๋„ ์ผ์ข…์˜ ์žฌ๋Šฅ์ด๋ผ๊ณ  ํ•  ์ˆ˜ ์žˆ๊ฒ ์ง€? ์šฐ๋ฆฌ ์žฌ๋Šฅ๋„ท์—์„œ๋Š” ์ด๋Ÿฐ ๊ณผํ•™ ์ง€์‹์„ ์‰ฝ๊ฒŒ ์„ค๋ช…ํ•ด์ฃผ๋Š” ์žฌ๋Šฅ ์žˆ๋Š” ๋ถ„๋“ค์„ ๋งŒ๋‚  ์ˆ˜ ์žˆ์–ด. ๊ณผํ•™์— ๊ด€์‹ฌ ์žˆ๋Š” ์นœ๊ตฌ๋“ค์€ ํ•œ ๋ฒˆ ๋“ค๋Ÿฌ๋ณด๋Š” ๊ฒƒ๋„ ์ข‹์„ ๊ฑฐ์•ผ!

๐Ÿ” Hi-C ๊ธฐ์ˆ : DNA์˜ 3D ์ง€๋„๋ฅผ ๊ทธ๋ฆฌ๋‹ค

์ž, ์ด์ œ ์šฐ๋ฆฌ์˜ ์ฃผ์ธ๊ณต Hi-C ๊ธฐ์ˆ ์— ๋Œ€ํ•ด ์•Œ์•„๋ณผ ์ฐจ๋ก€์•ผ. Hi-C๋Š” "High-throughput Chromosome Conformation Capture"์˜ ์•ฝ์ž์•ผ. ๋ญ”๊ฐ€ ์—„์ฒญ ๋ณต์žกํ•ด ๋ณด์ด์ง€? ๊ฑฑ์ • ๋งˆ, ์ฒœ์ฒœํžˆ ์„ค๋ช…ํ•ด์ค„๊ฒŒ. ๐Ÿ˜Š

Hi-C ๊ธฐ์ˆ ์€ ์—ผ์ƒ‰์ฒด์˜ 3D ๊ตฌ์กฐ๋ฅผ ์—ฐ๊ตฌํ•˜๋Š” ๊ฐ•๋ ฅํ•œ ๋„๊ตฌ์•ผ. ์ด ๊ธฐ์ˆ ์„ ์‚ฌ์šฉํ•˜๋ฉด DNA๊ฐ€ ์–ด๋–ป๊ฒŒ ์ ‘ํ˜€ ์žˆ๋Š”์ง€, ์–ด๋–ค ๋ถ€๋ถ„๋“ค์ด ์„œ๋กœ ๊ฐ€๊นŒ์ด ์žˆ๋Š”์ง€ ์•Œ ์ˆ˜ ์žˆ์–ด. ๋งˆ์น˜ ๋„์‹œ์˜ ์ง€๋„๋ฅผ ๊ทธ๋ฆฌ๋Š” ๊ฒƒ์ฒ˜๋Ÿผ, DNA์˜ ์ง€๋„๋ฅผ ๊ทธ๋ฆฌ๋Š” ๊ฑฐ์ง€!

๐Ÿ’ก ์•Œ์•„๋‘๋ฉด ์ข‹์€ ์ : Hi-C ๊ธฐ์ˆ ์€ 2009๋…„์— ์ฒ˜์Œ ๊ฐœ๋ฐœ๋์–ด. ๊ทธ ์ „์—๋Š” DNA์˜ 3D ๊ตฌ์กฐ๋ฅผ ์ด๋ ‡๊ฒŒ ์ž์„ธํžˆ ๋ณผ ์ˆ˜ ์žˆ๋Š” ๋ฐฉ๋ฒ•์ด ์—†์—ˆ์ง€. ์ด ๊ธฐ์ˆ  ๋•๋ถ„์— ์šฐ๋ฆฌ๋Š” DNA์˜ ์„ธ๊ณ„๋ฅผ ์ „ํ˜€ ์ƒˆ๋กœ์šด ์‹œ๊ฐ์œผ๋กœ ๋ณผ ์ˆ˜ ์žˆ๊ฒŒ ๋์–ด!

๊ทธ๋Ÿผ Hi-C ๊ธฐ์ˆ ์ด ์–ด๋–ป๊ฒŒ ์ž‘๋™ํ•˜๋Š”์ง€ ๊ฐ„๋‹จํžˆ ์„ค๋ช…ํ•ด๋ณผ๊ฒŒ. ์•„์ฃผ ๋ณต์žกํ•œ ๊ณผ์ •์ด์ง€๋งŒ, ์šฐ๋ฆฌ๋Š” ์‰ฝ๊ฒŒ ์ดํ•ดํ•  ์ˆ˜ ์žˆ๋„๋ก ๋‹จ๊ณ„๋ณ„๋กœ ๋‚˜๋ˆ ๋ณผ ๊ฑฐ์•ผ.

  1. DNA ๊ณ ์ •ํ•˜๊ธฐ: ๋จผ์ € ์„ธํฌ ์•ˆ์˜ DNA๋ฅผ ํ™”ํ•™๋ฌผ์งˆ๋กœ ๊ณ ์ •์‹œ์ผœ. ์ด๋ ‡๊ฒŒ ํ•˜๋ฉด ์„œ๋กœ ๊ฐ€๊นŒ์ด ์žˆ๋Š” DNA ๋ถ€๋ถ„๋“ค์ด ๋ถ™์–ด์žˆ๊ฒŒ ๋ผ.
  2. DNA ์ž๋ฅด๊ธฐ: ๊ทธ ๋‹ค์Œ, ํŠน๋ณ„ํ•œ ํšจ์†Œ๋ฅผ ์‚ฌ์šฉํ•ด์„œ DNA๋ฅผ ์ž˜๋ผ. ๋งˆ์น˜ ๊ธด ๋ˆ์„ ์—ฌ๋Ÿฌ ์กฐ๊ฐ์œผ๋กœ ์ž๋ฅด๋Š” ๊ฒƒ์ฒ˜๋Ÿผ ๋ง์ด์•ผ.
  3. DNA ๋ ํ‘œ์‹œํ•˜๊ธฐ: ์ž˜๋ฆฐ DNA์˜ ๋๋ถ€๋ถ„์— ํŠน๋ณ„ํ•œ ํ‘œ์‹œ๋ฅผ ํ•ด. ์ด๊ฑด ๋‚˜์ค‘์— ์–ด๋–ค ๋ถ€๋ถ„๋“ค์ด ์„œ๋กœ ๊ฐ€๊นŒ์ด ์žˆ์—ˆ๋Š”์ง€ ์•Œ์•„๋‚ด๊ธฐ ์œ„ํ•œ ๊ฑฐ์•ผ.
  4. DNA ๋‹ค์‹œ ๋ถ™์ด๊ธฐ: ์ž˜๋ฆฐ DNA ์กฐ๊ฐ๋“ค์„ ๋‹ค์‹œ ๋ถ™์—ฌ. ์ด๋•Œ ์„œ๋กœ ๊ฐ€๊นŒ์ด ์žˆ๋˜ ๋ถ€๋ถ„๋“ค์ด ์—ฐ๊ฒฐ๋˜๊ฒŒ ๋ผ.
  5. DNA ๋ถ„์„ํ•˜๊ธฐ: ๋งˆ์ง€๋ง‰์œผ๋กœ, ์ด๋ ‡๊ฒŒ ๋งŒ๋“ค์–ด์ง„ DNA๋ฅผ ๋ถ„์„ํ•ด์„œ ์–ด๋–ค ๋ถ€๋ถ„๋“ค์ด ์„œ๋กœ ๊ฐ€๊นŒ์ด ์žˆ์—ˆ๋Š”์ง€ ์•Œ์•„๋‚ด๋Š” ๊ฑฐ์•ผ.
Hi-C ๊ธฐ์ˆ ์˜ ๋‹จ๊ณ„ DNA ๊ณ ์ •ํ•˜๊ธฐ DNA ์ž๋ฅด๊ธฐ DNA ๋ ํ‘œ์‹œํ•˜๊ธฐ DNA ๋‹ค์‹œ ๋ถ™์ด๊ธฐ DNA ๋ถ„์„ํ•˜๊ธฐ

์ด๋ ‡๊ฒŒ Hi-C ๊ธฐ์ˆ ์„ ์‚ฌ์šฉํ•˜๋ฉด DNA์˜ 3D ๊ตฌ์กฐ๋ฅผ ์•„์ฃผ ์ž์„ธํžˆ ๋ณผ ์ˆ˜ ์žˆ์–ด. ๋งˆ์น˜ ๋„์‹œ์˜ ํ•ญ๊ณต ์‚ฌ์ง„์„ ์ฐ๋Š” ๊ฒƒ์ฒ˜๋Ÿผ ๋ง์ด์•ผ. ์ด ๊ธฐ์ˆ  ๋•๋ถ„์— ์šฐ๋ฆฌ๋Š” DNA๊ฐ€ ์–ด๋–ป๊ฒŒ ์ ‘ํ˜€ ์žˆ๊ณ , ์–ด๋–ค ๋ถ€๋ถ„๋“ค์ด ์„œ๋กœ ๊ฐ€๊นŒ์ด ์žˆ๋Š”์ง€ ์•Œ ์ˆ˜ ์žˆ๊ฒŒ ๋์–ด.

๊ทธ๋Ÿฐ๋ฐ ์™œ ์ด๋Ÿฐ ๊ฒŒ ์ค‘์š”ํ• ๊นŒ? ๐Ÿค” DNA์˜ 3D ๊ตฌ์กฐ๋ฅผ ์•„๋Š” ๊ฒƒ์ด ์™œ ๊ทธ๋ ‡๊ฒŒ ๋Œ€๋‹จํ•œ ๊ฑธ๊นŒ? ๊ทธ ์ด์œ ๋Š” DNA์˜ ๊ตฌ์กฐ๊ฐ€ ์œ ์ „์ž์˜ ํ™œ์„ฑํ™”์™€ ๋ฐ€์ ‘ํ•œ ๊ด€๋ จ์ด ์žˆ๊ธฐ ๋•Œ๋ฌธ์ด์•ผ. ์–ด๋–ค ์œ ์ „์ž๋“ค์€ ์„œ๋กœ ๊ฐ€๊นŒ์ด ์žˆ์„ ๋•Œ ๋” ์ž˜ ์ž‘๋™ํ•˜๊ณ , ๋˜ ์–ด๋–ค ์œ ์ „์ž๋“ค์€ ๋ฉ€๋ฆฌ ๋–จ์–ด์ ธ ์žˆ์–ด์•ผ ์ œ๋Œ€๋กœ ๊ธฐ๋Šฅ์„ ํ•œ๋‹ค๊ณ  ํ•ด.

์˜ˆ๋ฅผ ๋“ค์–ด, A๋ผ๋Š” ์œ ์ „์ž์™€ B๋ผ๋Š” ์œ ์ „์ž๊ฐ€ ์žˆ๋‹ค๊ณ  ํ•ด๋ณด์ž. ์ด ๋‘ ์œ ์ „์ž๊ฐ€ 3D ๊ณต๊ฐ„์—์„œ ๊ฐ€๊นŒ์ด ์žˆ์œผ๋ฉด, ์„œ๋กœ ์˜ํ–ฅ์„ ์ฃผ๊ณ ๋ฐ›์•„ ํŠน์ •ํ•œ ๋‹จ๋ฐฑ์งˆ์„ ๋งŒ๋“ค์–ด๋‚ผ ์ˆ˜ ์žˆ์–ด. ํ•˜์ง€๋งŒ ๋ฉ€๋ฆฌ ๋–จ์–ด์ ธ ์žˆ์œผ๋ฉด ๊ทธ๋Ÿฐ ์ผ์ด ์ผ์–ด๋‚˜์ง€ ์•Š๊ฒ ์ง€. Hi-C ๊ธฐ์ˆ ์„ ์‚ฌ์šฉํ•˜๋ฉด ์ด๋Ÿฐ ๊ด€๊ณ„๋ฅผ ์ •ํ™•ํžˆ ํŒŒ์•…ํ•  ์ˆ˜ ์žˆ๋Š” ๊ฑฐ์•ผ.

๐ŸŽจ ์ƒ์ƒํ•ด๋ณด๊ธฐ: DNA๋ฅผ ๊ฑฐ๋Œ€ํ•œ ๊ทธ๋ฆผ์ด๋ผ๊ณ  ์ƒ๊ฐํ•ด๋ด. ๊ทธ๋Ÿฐ๋ฐ ์ด ๊ทธ๋ฆผ์ด ์•„์ฃผ ๋ณต์žกํ•˜๊ฒŒ ์ ‘ํ˜€์žˆ์–ด์„œ ์–ด๋–ค ๋ถ€๋ถ„์ด ์–ด๋”” ์žˆ๋Š”์ง€ ์•Œ๊ธฐ ์–ด๋ ค์›Œ. Hi-C ๊ธฐ์ˆ ์€ ์ด ๊ทธ๋ฆผ์„ ํŽผ์ณ์„œ ์ „์ฒด ๋ชจ์Šต์„ ๋ณผ ์ˆ˜ ์žˆ๊ฒŒ ํ•ด์ฃผ๋Š” ๊ฑฐ์•ผ. ๊ทธ๋Ÿฌ๋ฉด ์šฐ๋ฆฌ๋Š” ๊ทธ๋ฆผ์˜ ๊ฐ ๋ถ€๋ถ„์ด ์–ด๋–ป๊ฒŒ ์—ฐ๊ฒฐ๋˜์–ด ์žˆ๊ณ , ์–ด๋–ค ์˜๋ฏธ๋ฅผ ๊ฐ€์ง€๋Š”์ง€ ๋” ์ž˜ ์ดํ•ดํ•  ์ˆ˜ ์žˆ๊ฒ ์ง€?

Hi-C ๊ธฐ์ˆ ์€ ์ •๋ง ๋Œ€๋‹จํ•˜์ง€๋งŒ, ํ•œ ๊ฐ€์ง€ ์ฃผ์˜ํ•  ์ ์ด ์žˆ์–ด. ๋ฐ”๋กœ ์—„์ฒญ๋‚œ ์–‘์˜ ๋ฐ์ดํ„ฐ๋ฅผ ๋งŒ๋“ค์–ด๋‚ธ๋‹ค๋Š” ๊ฑฐ์•ผ. ์ด ๋ฐ์ดํ„ฐ๋ฅผ ๋ถ„์„ํ•˜๋ ค๋ฉด ์•„์ฃผ ๊ฐ•๋ ฅํ•œ ์ปดํ“จํ„ฐ์™€ ๋ณต์žกํ•œ ์ˆ˜ํ•™์  ๊ณ„์‚ฐ์ด ํ•„์š”ํ•ด. ๊ทธ๋ž˜์„œ Hi-C ๋ฐ์ดํ„ฐ๋ฅผ ๋‹ค๋ฃจ๋Š” ๊ฒƒ์€ ๋˜ ๋‹ค๋ฅธ ์ „๋ฌธ ๋ถ„์•ผ๊ฐ€ ๋˜์—ˆ์ง€.

์—ฌ๊ธฐ์„œ ์ž ๊น! ๐Ÿ–ฅ๏ธ ์ด๋Ÿฐ ๋ณต์žกํ•œ ๋ฐ์ดํ„ฐ๋ฅผ ๋‹ค๋ฃจ๋Š” ๋Šฅ๋ ฅ๋„ ๊ต‰์žฅํ•œ ์žฌ๋Šฅ์ด์•ผ. ์žฌ๋Šฅ๋„ท์—์„œ๋Š” ์ด๋Ÿฐ ์ƒ๋ฌผ์ •๋ณดํ•™ ๋ถ„์•ผ์˜ ์ „๋ฌธ๊ฐ€๋“ค๋„ ๋งŒ๋‚  ์ˆ˜ ์žˆ์–ด. ๋ฐ์ดํ„ฐ ๋ถ„์„์— ๊ด€์‹ฌ ์žˆ๋Š” ์นœ๊ตฌ๋“ค์€ ํ•œ ๋ฒˆ ์ฐพ์•„๋ณด๋Š” ๊ฒƒ๋„ ์ข‹์„ ๊ฑฐ์•ผ!

์ž, ์ด์ œ Hi-C ๊ธฐ์ˆ ์— ๋Œ€ํ•ด ๊ธฐ๋ณธ์ ์ธ ์ดํ•ด๋ฅผ ํ–ˆ์œผ๋‹ˆ, ์ด ๊ธฐ์ˆ ์ด ์‹ค์ œ๋กœ ์–ด๋–ป๊ฒŒ ์‘์šฉ๋˜๋Š”์ง€ ๋” ์ž์„ธํžˆ ์•Œ์•„๋ณผ๊นŒ? ๋‹ค์Œ ์„น์…˜์—์„œ ๊ณ„์†ํ•ด์„œ ์ด์•ผ๊ธฐํ•ด๋ณผ๊ฒŒ!

๐Ÿงช Hi-C ๊ธฐ์ˆ ์˜ ๋†€๋ผ์šด ์‘์šฉ

์ž, ์ด์ œ Hi-C ๊ธฐ์ˆ ์ด ์‹ค์ œ๋กœ ์–ด๋–ป๊ฒŒ ์‚ฌ์šฉ๋˜๋Š”์ง€ ์•Œ์•„๋ณผ ์ฐจ๋ก€์•ผ. ์ด ๊ธฐ์ˆ ์€ ์ •๋ง ๋‹ค์–‘ํ•œ ๋ถ„์•ผ์—์„œ ํ™œ์šฉ๋˜๊ณ  ์žˆ์–ด. ๋งˆ์น˜ ์Šค์œ„์Šค ๊ตฐ์šฉ ์นผ์ฒ˜๋Ÿผ ์—ฌ๋Ÿฌ ๊ฐ€์ง€ ์šฉ๋„๋กœ ์“ฐ์ด๊ณ  ์žˆ์ง€. ๊ทธ๋Ÿผ ํ•˜๋‚˜์”ฉ ์‚ดํŽด๋ณผ๊นŒ? ๐Ÿ˜Ž

1. ์œ ์ „์ฒด ์กฐ๋ฆฝ (Genome Assembly)

์ฒซ ๋ฒˆ์งธ๋กœ Hi-C ๊ธฐ์ˆ ์€ ์œ ์ „์ฒด ์กฐ๋ฆฝ์— ์‚ฌ์šฉ๋ผ. ์œ ์ „์ฒด ์กฐ๋ฆฝ์ด ๋ญ๋ƒ๊ณ ? ์Œ... ํผ์ฆ์„ ๋งž์ถ”๋Š” ๊ฑธ ์ƒ์ƒํ•ด๋ด. ๊ทผ๋ฐ ์ด ํผ์ฆ์˜ ์กฐ๊ฐ์ด ์ˆ˜๋ฐฑ๋งŒ ๊ฐœ์•ผ! ๊ฒŒ๋‹ค๊ฐ€ ์–ด๋–ค ์กฐ๊ฐ๋“ค์€ ๊ฑฐ์˜ ๋˜‘๊ฐ™์ด ์ƒ๊ฒผ์–ด. ์ด๋Ÿฐ ํผ์ฆ์„ ๋งž์ถ”๋Š” ๊ฒŒ ๋ฐ”๋กœ ์œ ์ „์ฒด ์กฐ๋ฆฝ์ด์•ผ.

Hi-C ๊ธฐ์ˆ ์€ ์ด ํผ์ฆ ์กฐ๊ฐ๋“ค์ด ์–ด๋–ป๊ฒŒ ์—ฐ๊ฒฐ๋˜์–ด ์žˆ๋Š”์ง€ ์•Œ๋ ค์ค˜. ๋งˆ์น˜ ํผ์ฆ์˜ ์ „์ฒด ๊ทธ๋ฆผ์„ ํ๋ฆฟํ•˜๊ฒŒ๋‚˜๋งˆ ๋ณผ ์ˆ˜ ์žˆ๊ฒŒ ํ•ด์ฃผ๋Š” ๊ฑฐ์ง€. ์ด๋ ‡๊ฒŒ ํ•˜๋ฉด ํ›จ์”ฌ ๋” ์‰ฝ๊ณ  ์ •ํ™•ํ•˜๊ฒŒ ์œ ์ „์ฒด๋ฅผ ์กฐ๋ฆฝํ•  ์ˆ˜ ์žˆ์–ด.

๐Ÿงฉ ์‹ค์ œ ์‚ฌ๋ก€: 2017๋…„์— ๊ณผํ•™์ž๋“ค์ด Hi-C ๊ธฐ์ˆ ์„ ์‚ฌ์šฉํ•ด์„œ ์ธ๊ฐ„ ์œ ์ „์ฒด์˜ ์ƒˆ๋กœ์šด ๋ฒ„์ „์„ ๋งŒ๋“ค์—ˆ์–ด. ์ด์ „ ๋ฒ„์ „๋ณด๋‹ค ํ›จ์”ฌ ๋” ์ •ํ™•ํ•˜๊ณ  ์™„์„ฑ๋„๊ฐ€ ๋†’์•˜์ง€. ์ด๊ฑด ๋งˆ์น˜ ํ๋ฆฟํ•œ ์ง€๋„๋ฅผ ๊ฐ€์ง€๊ณ  ์žˆ๋‹ค๊ฐ€ ๊ฐ‘์ž๊ธฐ ๊ณ ํ•ด์ƒ๋„ ์œ„์„ฑ ์‚ฌ์ง„์„ ์–ป์€ ๊ฒƒ๊ณผ ๊ฐ™์€ ๊ฑฐ์•ผ!

2. ์œ ์ „์ž ์กฐ์ ˆ ๋ฉ”์ปค๋‹ˆ์ฆ˜ ์—ฐ๊ตฌ

๋‘ ๋ฒˆ์งธ๋กœ, Hi-C ๊ธฐ์ˆ ์€ ์œ ์ „์ž๊ฐ€ ์–ด๋–ป๊ฒŒ ์ผœ์ง€๊ณ  ๊บผ์ง€๋Š”์ง€ ์—ฐ๊ตฌํ•˜๋Š” ๋ฐ ์‚ฌ์šฉ๋ผ. ์šฐ๋ฆฌ ๋ชธ์˜ ๋ชจ๋“  ์„ธํฌ๋Š” ๊ฐ™์€ DNA๋ฅผ ๊ฐ€์ง€๊ณ  ์žˆ์ง€๋งŒ, ๊ฐ ์„ธํฌ๋Š” ๋‹ค๋ฅด๊ฒŒ ์ž‘๋™ํ•ด. ์–ด๋–ค ์„ธํฌ๋Š” ๊ทผ์œก์ด ๋˜๊ณ , ์–ด๋–ค ์„ธํฌ๋Š” ๋‡Œ๊ฐ€ ๋˜๋Š” ์‹์ด์ง€. ์ด๊ฑด ๊ฐ ์„ธํฌ์—์„œ ๋‹ค๋ฅธ ์œ ์ „์ž๋“ค์ด ํ™œ์„ฑํ™”๋˜๊ธฐ ๋•Œ๋ฌธ์ด์•ผ.

Hi-C ๊ธฐ์ˆ ์„ ์‚ฌ์šฉํ•˜๋ฉด ์–ด๋–ค ์œ ์ „์ž๋“ค์ด ์„œ๋กœ ๊ฐ€๊นŒ์ด ์žˆ๋Š”์ง€ ์•Œ ์ˆ˜ ์žˆ์–ด. ์ด๊ฑธ ํ†ตํ•ด ์–ด๋–ค ์œ ์ „์ž๋“ค์ด ํ•จ๊ป˜ ์ž‘๋™ํ•˜๋Š”์ง€, ์–ด๋–ค ์œ ์ „์ž๋“ค์ด ์„œ๋กœ ์˜ํ–ฅ์„ ์ฃผ๋Š”์ง€ ์•Œ์•„๋‚ผ ์ˆ˜ ์žˆ์ง€.

์œ ์ „์ž ์กฐ์ ˆ ๋ฉ”์ปค๋‹ˆ์ฆ˜ ์œ ์ „์ž A ์œ ์ „์ž B ์œ ์ „์ž C ์œ ์ „์ž ๊ฐ„ ์ƒํ˜ธ์ž‘์šฉ

์œ„์˜ ๊ทธ๋ฆผ์„ ๋ณด๋ฉด, ์œ ์ „์ž A, B, C๊ฐ€ ์„œ๋กœ ์–ด๋–ป๊ฒŒ ์—ฐ๊ฒฐ๋˜์–ด ์žˆ๋Š”์ง€ ๋ณผ ์ˆ˜ ์žˆ์–ด. ์ด๋Ÿฐ ์—ฐ๊ฒฐ ๊ด€๊ณ„๋ฅผ ์•„๋Š” ๊ฒƒ์ด ์œ ์ „์ž ์กฐ์ ˆ ๋ฉ”์ปค๋‹ˆ์ฆ˜์„ ์ดํ•ดํ•˜๋Š” ๋ฐ ํฐ ๋„์›€์ด ๋ผ.

3. ์งˆ๋ณ‘ ์—ฐ๊ตฌ

์„ธ ๋ฒˆ์งธ๋กœ, Hi-C ๊ธฐ์ˆ ์€ ๋‹ค์–‘ํ•œ ์งˆ๋ณ‘์„ ์—ฐ๊ตฌํ•˜๋Š” ๋ฐ ์‚ฌ์šฉ๋ผ. ํŠนํžˆ ์•” ์—ฐ๊ตฌ์—์„œ ๋งŽ์ด ํ™œ์šฉ๋˜๊ณ  ์žˆ์–ด. ์™œ๋ƒํ•˜๋ฉด ๋งŽ์€ ์•”์€ DNA์˜ ๊ตฌ์กฐ๊ฐ€ ๋ณ€ํ˜•๋˜๋ฉด์„œ ๋ฐœ์ƒํ•˜๊ฑฐ๋“ .

์˜ˆ๋ฅผ ๋“ค์–ด, ์–ด๋–ค ์•”์—์„œ๋Š” ๋‘ ๊ฐœ์˜ ๋‹ค๋ฅธ ์—ผ์ƒ‰์ฒด๊ฐ€ ์„œ๋กœ ๋ถ™์–ด๋ฒ„๋ฆฌ๋Š” ๊ฒฝ์šฐ๊ฐ€ ์žˆ์–ด. ์ด๊ฑธ ์—ผ์ƒ‰์ฒด ์ „์ขŒ๋ผ๊ณ  ํ•ด. Hi-C ๊ธฐ์ˆ ์„ ์‚ฌ์šฉํ•˜๋ฉด ์ด๋Ÿฐ ๋น„์ •์ƒ์ ์ธ DNA ๊ตฌ์กฐ๋ฅผ ์‰ฝ๊ฒŒ ๋ฐœ๊ฒฌํ•  ์ˆ˜ ์žˆ์ง€.

๐Ÿฅ ์˜ํ•™์  ์‘์šฉ: ์ตœ๊ทผ์—๋Š” Hi-C ๊ธฐ์ˆ ์„ ์‚ฌ์šฉํ•ด์„œ ์žํ์ฆ๊ณผ ๊ด€๋ จ๋œ ์œ ์ „์ž๋“ค์„ ๋ฐœ๊ฒฌํ–ˆ์–ด. ์ด ์œ ์ „์ž๋“ค์ด 3D ๊ณต๊ฐ„์—์„œ ์„œ๋กœ ๊ฐ€๊นŒ์ด ์žˆ๋‹ค๋Š” ๊ฑธ ์•Œ์•„๋ƒˆ์ง€. ์ด๋Ÿฐ ๋ฐœ๊ฒฌ์€ ์žํ์ฆ์˜ ์›์ธ์„ ์ดํ•ดํ•˜๊ณ  ์ƒˆ๋กœ์šด ์น˜๋ฃŒ๋ฒ•์„ ๊ฐœ๋ฐœํ•˜๋Š” ๋ฐ ํฐ ๋„์›€์ด ๋  ๊ฑฐ์•ผ.

4. ์ง„ํ™” ์—ฐ๊ตฌ

๋„ค ๋ฒˆ์งธ๋กœ, Hi-C ๊ธฐ์ˆ ์€ ์ƒ๋ฌผ์˜ ์ง„ํ™”๋ฅผ ์—ฐ๊ตฌํ•˜๋Š” ๋ฐ๋„ ์‚ฌ์šฉ๋ผ. ์„œ๋กœ ๋‹ค๋ฅธ ์ƒ๋ฌผ ์ข…์˜ DNA ๊ตฌ์กฐ๋ฅผ ๋น„๊ตํ•˜๋ฉด, ์–ด๋–ค ๋ถ€๋ถ„์ด ์ง„ํ™” ๊ณผ์ •์—์„œ ๋ณด์กด๋˜์—ˆ๋Š”์ง€ ์•Œ ์ˆ˜ ์žˆ์–ด.

์˜ˆ๋ฅผ ๋“ค์–ด, ์ธ๊ฐ„๊ณผ ์นจํŒฌ์ง€์˜ DNA ๊ตฌ์กฐ๋ฅผ ๋น„๊ตํ•ด๋ณด๋ฉด ์–ด๋–จ๊นŒ? ๋‘ ์ข…์€ ์œ ์ „์ž ์„œ์—ด์ด ๋งค์šฐ ๋น„์Šทํ•˜์ง€๋งŒ, DNA์˜ 3D ๊ตฌ์กฐ์—๋Š” ์ฐจ์ด๊ฐ€ ์žˆ์„ ์ˆ˜ ์žˆ์–ด. ์ด๋Ÿฐ ์ฐจ์ด๋ฅผ ์—ฐ๊ตฌํ•˜๋ฉด ์ธ๊ฐ„์ด ์–ด๋–ป๊ฒŒ ์ง„ํ™”ํ–ˆ๋Š”์ง€ ๋” ์ž˜ ์ดํ•ดํ•  ์ˆ˜ ์žˆ์ง€.

์ด๋ ‡๊ฒŒ Hi-C ๊ธฐ์ˆ ์€ ์ •๋ง ๋‹ค์–‘ํ•œ ๋ถ„์•ผ์—์„œ ํ™œ์šฉ๋˜๊ณ  ์žˆ์–ด. ์ƒ๋ฌผํ•™, ์˜ํ•™, ์ง„ํ™”ํ•™ ๋“ฑ ์—ฌ๋Ÿฌ ๋ถ„์•ผ์˜ ์—ฐ๊ตฌ์ž๋“ค์ด ์ด ๊ธฐ์ˆ ์„ ์‚ฌ์šฉํ•ด์„œ ์ƒˆ๋กœ์šด ๋ฐœ๊ฒฌ์„ ํ•˜๊ณ  ์žˆ์ง€. ๐Ÿ˜Š

๊ทธ๋Ÿฐ๋ฐ ๋ง์ด์•ผ, ์ด๋Ÿฐ ๋ณต์žกํ•œ ์—ฐ๊ตฌ๋ฅผ ํ•˜๋ ค๋ฉด ๋‹ค์–‘ํ•œ ๋ถ„์•ผ์˜ ์ „๋ฌธ๊ฐ€๋“ค์ด ํ˜‘๋ ฅํ•ด์•ผ ํ•ด. ์ƒ๋ฌผํ•™์ž, ์ปดํ“จํ„ฐ ๊ณผํ•™์ž, ํ†ต๊ณ„ํ•™์ž ๋“ฑ์ด ๋ชจ๋‘ ํ•„์š”ํ•˜์ง€. ์ด๋Ÿฐ ์ ์—์„œ ์žฌ๋Šฅ๋„ท๊ฐ™์€ ํ”Œ๋žซํผ์ด ์ค‘์š”ํ•  ์ˆ˜ ์žˆ์–ด. ๋‹ค์–‘ํ•œ ๋ถ„์•ผ์˜ ์ „๋ฌธ๊ฐ€๋“ค์ด ๋งŒ๋‚˜์„œ ํ˜‘๋ ฅํ•  ์ˆ˜ ์žˆ๋Š” ์žฅ์„ ์ œ๊ณตํ•˜๋‹ˆ๊นŒ.

์ž, ์ด์ œ Hi-C ๊ธฐ์ˆ ์˜ ์‘์šฉ์— ๋Œ€ํ•ด ์•Œ์•„๋ดค์–ด. ์ •๋ง ๋Œ€๋‹จํ•˜์ง€ ์•Š์•„? ์ด ๊ธฐ์ˆ  ๋•๋ถ„์— ์šฐ๋ฆฌ๋Š” DNA์˜ ์„ธ๊ณ„๋ฅผ ์ „ํ˜€ ์ƒˆ๋กœ์šด ์‹œ๊ฐ์œผ๋กœ ๋ณผ ์ˆ˜ ์žˆ๊ฒŒ ๋์–ด. ๊ทธ๋Ÿผ ์ด์ œ Hi-C ๊ธฐ์ˆ ์˜ ํ•œ๊ณ„์™€ ์•ž์œผ๋กœ์˜ ์ „๋ง์— ๋Œ€ํ•ด ์•Œ์•„๋ณผ๊นŒ?

๐Ÿ”ฎ Hi-C ๊ธฐ์ˆ ์˜ ํ•œ๊ณ„์™€ ๋ฏธ๋ž˜ ์ „๋ง

์ž, ์ด์ œ Hi-C ๊ธฐ์ˆ ์˜ ํ•œ๊ณ„์™€ ์•ž์œผ๋กœ์˜ ๊ฐ€๋Šฅ์„ฑ์— ๋Œ€ํ•ด ์ด์•ผ๊ธฐํ•ด๋ณผ ์ฐจ๋ก€์•ผ. ์–ด๋–ค ๊ธฐ์ˆ ์ด๋“  ์žฅ์ ๋งŒ ์žˆ๋Š” ๊ฑด ์•„๋‹ˆ์ž–์•„? Hi-C ๊ธฐ์ˆ ๋„ ๋งˆ์ฐฌ๊ฐ€์ง€๋กœ ๋ช‡ ๊ฐ€์ง€ ํ•œ๊ณ„๊ฐ€ ์žˆ์–ด. ํ•˜์ง€๋งŒ ๊ฑฑ์ •ํ•˜์ง€ ๋งˆ! ๊ณผํ•™์ž๋“ค์ด ์ด๋Ÿฐ ํ•œ๊ณ„๋ฅผ ๊ทน๋ณตํ•˜๊ธฐ ์œ„ํ•ด ์—ด์‹ฌํžˆ ๋…ธ๋ ฅํ•˜๊ณ  ์žˆ๊ฑฐ๋“ . ๊ทธ๋Ÿผ ํ•จ๊ป˜ ์‚ดํŽด๋ณผ๊นŒ? ๐Ÿ•ต๏ธโ€โ™€๏ธ

1. ํ•ด์ƒ๋„์˜ ํ•œ๊ณ„

Hi-C ๊ธฐ์ˆ ์˜ ์ฒซ ๋ฒˆ์งธ ํ•œ๊ณ„๋Š” ๋ฐ”๋กœ ํ•ด์ƒ๋„์•ผ. Hi-C๋Š” DNA์˜ ํฐ ๊ทธ๋ฆผ์„ ๋ณด์—ฌ์ฃผ๋Š” ๋ฐ๋Š” ์ •๋ง ๋›ฐ์–ด๋‚˜์ง€๋งŒ, ์•„์ฃผ ์ž‘์€ ๋ถ€๋ถ„์˜ ์ƒ์„ธํ•œ ๊ตฌ์กฐ๋ฅผ ๋ณด์—ฌ์ฃผ๊ธฐ๋Š” ์–ด๋ ค์›Œ. ๋งˆ์น˜ ์œ„์„ฑ์—์„œ ์ง€๊ตฌ๋ฅผ ๋ณด๋Š” ๊ฒƒ๊ณผ ๋น„์Šทํ•ด. ๋Œ€๋ฅ™๊ณผ ๋ฐ”๋‹ค๋Š” ์ž˜ ๋ณด์ด์ง€๋งŒ, ์ž‘์€ ๊ฑด๋ฌผ ํ•˜๋‚˜ํ•˜๋‚˜๋Š” ๊ตฌ๋ถ„ํ•˜๊ธฐ ์–ด๋ ต์ž–์•„?

๐Ÿ” ํ•ด๊ฒฐ ๋ฐฉ์•ˆ: ๊ณผํ•™์ž๋“ค์€ ์ด ๋ฌธ์ œ๋ฅผ ํ•ด๊ฒฐํ•˜๊ธฐ ์œ„ํ•ด Hi-C ๊ธฐ์ˆ ์„ ๋‹ค๋ฅธ ๊ธฐ์ˆ ๋“ค๊ณผ ๊ฒฐํ•ฉํ•˜๊ณ  ์žˆ์–ด. ์˜ˆ๋ฅผ ๋“ค์–ด, ๋‹จ์ผ ์„ธํฌ Hi-C๋ผ๋Š” ์ƒˆ๋กœ์šด ๋ฐฉ๋ฒ•์„ ๊ฐœ๋ฐœํ–ˆ์–ด. ์ด ๋ฐฉ๋ฒ•์„ ์‚ฌ์šฉํ•˜๋ฉด ๊ฐœ๋ณ„ ์„ธํฌ์˜ DNA ๊ตฌ์กฐ๋ฅผ ๋” ์ž์„ธํžˆ ๋ณผ ์ˆ˜ ์žˆ์ง€.

2. ๋ฐ์ดํ„ฐ ๋ถ„์„์˜ ์–ด๋ ค์›€

๋‘ ๋ฒˆ์งธ ํ•œ๊ณ„๋Š” ์—„์ฒญ๋‚œ ์–‘์˜ ๋ฐ์ดํ„ฐ๋ฅผ ๋‹ค๋ฃจ์–ด์•ผ ํ•œ๋‹ค๋Š” ๊ฑฐ์•ผ. Hi-C ์‹คํ—˜ ํ•œ ๋ฒˆ์œผ๋กœ ์ˆ˜์‹ญ์–ต ๊ฐœ์˜ ๋ฐ์ดํ„ฐ ํฌ์ธํŠธ๊ฐ€ ์ƒ์„ฑ๋ผ. ์ด๊ฑธ ๋ถ„์„ํ•˜๋ ค๋ฉด ์ •๋ง ๊ฐ•๋ ฅํ•œ ์ปดํ“จํ„ฐ์™€ ๋ณต์žกํ•œ ์•Œ๊ณ ๋ฆฌ์ฆ˜์ด ํ•„์š”ํ•ด.

Hi-C ๋ฐ์ดํ„ฐ ๋ถ„์„์˜ ๋ณต์žก์„ฑ Hi-C ์‹คํ—˜ ์ˆ˜์‹ญ์–ต ๊ฐœ์˜ ๋ฐ์ดํ„ฐ ํฌ์ธํŠธ ๊ฐ•๋ ฅํ•œ ์ปดํ“จํ„ฐ ๋ณต์žกํ•œ ์•Œ๊ณ ๋ฆฌ์ฆ˜ ์˜๋ฏธ ์žˆ๋Š” ๊ฒฐ๊ณผ

์œ„ ๊ทธ๋ฆผ์„ ๋ณด๋ฉด Hi-C ๋ฐ์ดํ„ฐ๋ฅผ ๋ถ„์„ํ•˜๋Š” ๊ณผ์ •์ด ์–ผ๋งˆ๋‚˜ ๋ณต์žกํ•œ์ง€ ์•Œ ์ˆ˜ ์žˆ์–ด. ์‹คํ—˜ ๋ฐ์ดํ„ฐ์—์„œ ์˜๋ฏธ ์žˆ๋Š” ๊ฒฐ๊ณผ๋ฅผ ์–ป๊ธฐ๊นŒ์ง€ ์—ฌ๋Ÿฌ ๋‹จ๊ณ„๋ฅผ ๊ฑฐ์ณ์•ผ ํ•ด.

๐Ÿ’ป ํ•ด๊ฒฐ ๋ฐฉ์•ˆ: ์ด ๋ฌธ์ œ๋ฅผ ํ•ด๊ฒฐํ•˜๊ธฐ ์œ„ํ•ด ๊ณผํ•™์ž๋“ค์€ ๋” ํšจ์œจ์ ์ธ ๋ฐ์ดํ„ฐ ๋ถ„์„ ๋ฐฉ๋ฒ•์„ ๊ฐœ๋ฐœํ•˜๊ณ  ์žˆ์–ด. ์ธ๊ณต์ง€๋Šฅ๊ณผ ๊ธฐ๊ณ„ํ•™์Šต์„ ํ™œ์šฉํ•ด์„œ ๋ฐ์ดํ„ฐ ๋ถ„์„ ์†๋„๋ฅผ ๋†’์ด๊ณ  ์žˆ์ง€. ๋˜, ํด๋ผ์šฐ๋“œ ์ปดํ“จํŒ…์„ ์ด์šฉํ•ด ๋” ๋งŽ์€ ์ปดํ“จํŒ… ํŒŒ์›Œ๋ฅผ ํ™•๋ณดํ•˜๊ณ  ์žˆ์–ด.

3. ์„ธํฌ ๊ฐ„ ์ฐจ์ด ๋ฐ˜์˜์˜ ์–ด๋ ค์›€

์„ธ ๋ฒˆ์งธ ํ•œ๊ณ„๋Š” ์„ธํฌ ๊ฐ„์˜ ์ฐจ์ด๋ฅผ ๋ฐ˜์˜ํ•˜๊ธฐ ์–ด๋ ต๋‹ค๋Š” ๊ฑฐ์•ผ. ๊ธฐ์กด์˜ Hi-C ๊ธฐ์ˆ ์€ ์ˆ˜๋งŽ์€ ์„ธํฌ์˜ ํ‰๊ท ์ ์ธ DNA ๊ตฌ์กฐ๋ฅผ ๋ณด์—ฌ์ค˜. ํ•˜์ง€๋งŒ ์‹ค์ œ๋กœ๋Š” ๊ฐ ์„ธํฌ๋งˆ๋‹ค DNA ๊ตฌ์กฐ๊ฐ€ ์กฐ๊ธˆ์”ฉ ๋‹ค๋ฅผ ์ˆ˜ ์žˆ์–ด.

๐Ÿ”ฌ ํ•ด๊ฒฐ ๋ฐฉ์•ˆ: ์ด ๋ฌธ์ œ๋ฅผ ํ•ด๊ฒฐํ•˜๊ธฐ ์œ„ํ•ด ๊ณผํ•™์ž๋“ค์€ ๋‹จ์ผ ์„ธํฌ Hi-C ๊ธฐ์ˆ ์„ ๊ฐœ๋ฐœํ–ˆ์–ด. ์ด ๊ธฐ์ˆ ์„ ์‚ฌ์šฉํ•˜๋ฉด ๊ฐœ๋ณ„ ์„ธํฌ์˜ DNA ๊ตฌ์กฐ๋ฅผ ๋ณผ ์ˆ˜ ์žˆ์ง€. ์ด๋ฅผ ํ†ตํ•ด ์„ธํฌ ๊ฐ„์˜ ์ฐจ์ด๋ฅผ ๋” ์ž˜ ์ดํ•ดํ•  ์ˆ˜ ์žˆ๊ฒŒ ๋์–ด.

Hi-C ๊ธฐ์ˆ ์˜ ๋ฏธ๋ž˜

์ž, ์ด์ œ Hi-C ๊ธฐ์ˆ ์˜ ํ•œ๊ณ„์— ๋Œ€ํ•ด ์•Œ์•„๋ดค์–ด. ๊ทธ๋Ÿฐ๋ฐ ์ด๋Ÿฐ ํ•œ๊ณ„์—๋„ ๋ถˆ๊ตฌํ•˜๊ณ  Hi-C ๊ธฐ์ˆ ์˜ ๋ฏธ๋ž˜๋Š” ์ •๋ง ๋ฐ์•„ ๋ณด์—ฌ! ์™œ ๊ทธ๋Ÿฐ์ง€ ํ•จ๊ป˜ ์‚ดํŽด๋ณผ๊นŒ? ๐ŸŒŸ

  1. ๋” ๋†’์€ ํ•ด์ƒ๋„: ๊ธฐ์ˆ ์ด ๋ฐœ์ „ํ•˜๋ฉด์„œ Hi-C์˜ ํ•ด์ƒ๋„๋Š” ๊ณ„์† ๋†’์•„์ง€๊ณ  ์žˆ์–ด. ๋จธ์ง€์•Š์•„ ์šฐ๋ฆฌ๋Š” DNA์˜ ๊ตฌ์กฐ๋ฅผ ํ›จ์”ฌ ๋” ์ž์„ธํžˆ ๋ณผ ์ˆ˜ ์žˆ๊ฒŒ ๋  ๊ฑฐ์•ผ.
  2. ์‹ค์‹œ๊ฐ„ ๊ด€์ฐฐ: ํ˜„์žฌ Hi-C๋Š” ๊ณ ์ •๋œ ์„ธํฌ์˜ DNA ๊ตฌ์กฐ๋งŒ ๋ณผ ์ˆ˜ ์žˆ์–ด. ํ•˜์ง€๋งŒ ์•ž์œผ๋กœ๋Š” ์‚ด์•„์žˆ๋Š” ์„ธํฌ์˜ DNA ๊ตฌ์กฐ ๋ณ€ํ™”๋ฅผ ์‹ค์‹œ๊ฐ„์œผ๋กœ ๊ด€์ฐฐํ•  ์ˆ˜ ์žˆ๊ฒŒ ๋ ์ง€๋„ ๋ชฐ๋ผ.
  3. ๊ฐœ์ธ ๋งž์ถค ์˜ํ•™: Hi-C ๊ธฐ์ˆ ์ด ๋ฐœ์ „ํ•˜๋ฉด ๊ฐœ์ธ์˜ DNA ๊ตฌ์กฐ ์ฐจ์ด๋ฅผ ๋” ์ž˜ ์ดํ•ดํ•  ์ˆ˜ ์žˆ๊ฒŒ ๋  ๊ฑฐ์•ผ. ์ด๋ฅผ ํ†ตํ•ด ๊ฐ ๊ฐœ์ธ์—๊ฒŒ ๋งž๋Š” ๋งž์ถค ์น˜๋ฃŒ๋ฒ•์„ ๊ฐœ๋ฐœํ•  ์ˆ˜ ์žˆ๊ฒ ์ง€.
  4. ์ธ๊ณต์ง€๋Šฅ๊ณผ์˜ ๊ฒฐํ•ฉ: Hi-C ๋ฐ์ดํ„ฐ ๋ถ„์„์— ์ธ๊ณต์ง€๋Šฅ์„ ํ™œ์šฉํ•˜๋ฉด, ์ง€๊ธˆ๊นŒ์ง€ ๋ฐœ๊ฒฌํ•˜์ง€ ๋ชปํ–ˆ๋˜ ์ƒˆ๋กœ์šด ํŒจํ„ด์„ ์ฐพ์•„๋‚ผ ์ˆ˜ ์žˆ์„ ๊ฑฐ์•ผ.

์™€, ์ •๋ง ํฅ๋ฏธ์ง„์ง„ํ•˜์ง€ ์•Š์•„? Hi-C ๊ธฐ์ˆ ์€ ์šฐ๋ฆฌ๊ฐ€ DNA์˜ ์„ธ๊ณ„๋ฅผ ์ดํ•ดํ•˜๋Š” ๋ฐฉ์‹์„ ์™„์ „ํžˆ ๋ฐ”๊พธ๊ณ  ์žˆ์–ด. ์ด ๊ธฐ์ˆ ์ด ์•ž์œผ๋กœ ์–ด๋–ป๊ฒŒ ๋ฐœ์ „ํ• ์ง€, ๊ทธ๋ฆฌ๊ณ  ์–ด๋–ค ์ƒˆ๋กœ์šด ๋ฐœ๊ฒฌ์„ ๊ฐ€๋Šฅํ•˜๊ฒŒ ํ• ์ง€ ์ •๋ง ๊ธฐ๋Œ€๋ผ!

๐Ÿ’ก ์ƒ๊ฐํ•ด๋ณด๊ธฐ: Hi-C ๊ธฐ์ˆ ์ด ๋” ๋ฐœ์ „ํ•˜๋ฉด ์–ด๋–ค ์ผ๋“ค์ด ๊ฐ€๋Šฅํ•ด์งˆ๊นŒ? ์˜ˆ๋ฅผ ๋“ค์–ด, DNA์˜ 3D ๊ตฌ์กฐ๋ฅผ ์™„๋ฒฝํ•˜๊ฒŒ ์ดํ•ดํ•˜๊ฒŒ ๋˜๋ฉด ์–ด๋–ค ์ผ์ด ์ผ์–ด๋‚ ๊นŒ? ์œ ์ „์ž ์น˜๋ฃŒ๋‚˜ ์งˆ๋ณ‘ ์˜ˆ๋ฐฉ์— ์–ด๋–ค ์˜ํ–ฅ์„ ๋ฏธ์น  ์ˆ˜ ์žˆ์„๊นŒ?

์ž, ์ด์ œ ์šฐ๋ฆฌ์˜ Hi-C ๊ธฐ์ˆ  ์—ฌํ–‰์ด ๊ฑฐ์˜ ๋๋‚˜๊ฐ€๊ณ  ์žˆ์–ด. ์ด ๋†€๋ผ์šด ๊ธฐ์ˆ ์— ๋Œ€ํ•ด ๋งŽ์ด ๋ฐฐ์› ์ง€? Hi-C ๊ธฐ์ˆ ์€ ์šฐ๋ฆฌ๊ฐ€ DNA์˜ ๋น„๋ฐ€์„ ํ’€์–ด๊ฐ€๋Š” ๋ฐ ์ •๋ง ์ค‘์š”ํ•œ ๋„๊ตฌ๊ฐ€ ๋˜๊ณ  ์žˆ์–ด. ์•ž์œผ๋กœ ์ด ๊ธฐ์ˆ ์ด ์–ด๋–ป๊ฒŒ ๋ฐœ์ „ํ• ์ง€, ๊ทธ๋ฆฌ๊ณ  ์–ด๋–ค ์ƒˆ๋กœ์šด ๋ฐœ๊ฒฌ์„ ๊ฐ€๋Šฅํ•˜๊ฒŒ ํ• ์ง€ ์ •๋ง ๊ธฐ๋Œ€๋˜์ง€ ์•Š์•„?

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